Наказ N 322 від 27.09.93 Про затвердження Інструкції про порядок видачі, зберігання і знищення посвідчення особи моряка та Переліку морських, річкових портів України, капітани яких мають право видавати посвідчення особи моряка
	Наказ N 247 від 17.05.1994. Про затвердження Інструкції про порядок видачі ліцензій на здійснення агентування і фрахтування торговельного флоту, умов і правил здійснення агентування і фрахтування морського торговельного флоту та контроль
	Наказ N 424 від 05.08.1994. Про затвердження Інструкції про порядок видачі ліцензій на здійснення внутрішніх й міжнародних перевезень пасажирів і вантажів морським та річковим транспортом, умов і правил здійснення перевезень
	Наказ N 206 від 22.05.1995. Про внесення змін до Інструкції про порядок видачі суб'єктам підприємницької діяльності ліцензій на здійснення агентування і фрахтування морського торговельного флоту, (Мінтранс України від 17.05.1994 р. N 247)
	Наказ N 258 від 08.07.1995. Про затвердження тимчасових портових зборів по морському торговельному порту Усть-Дунайськ
	Наказ N 392 від 31.10.1995 Про затвердження Збірника тарифів на роботи та послуги, що надаються вантажовласникам морськими портами України
	Наказ N 214 від 27.06.1996. Про затвердження зборів і плат за послуги, що надаються суднам у морських торговельних портах України
	Наказ N 215 від 27.06.1996. Про внесення змін і доповнень до збірника тарифів на роботи та послуги, які надаються вантажовласникам морськими портами України
	КНД 31.5.001-96. Положение о ремонте судов на ведомственных ремонтных базах (05.08.1996)
	Наказ N 106 від 26.03.1997. Про затвердження змін і доповнень до збірника тарифів на роботи та послуги, які надаються вантажовласникам морськими портами України
	Наказ N 222 від 15.10.1996. Про затвердження розміру диференційованої плати за видачу ліцензій на використання радіочастот
	Наказ N 369 від 20.10.1997 Про утворення Інспекції Головного державного реєстратора флоту
	(Втратив чинність МТУ 654 від 19.07.2004 ) Наказ 11 від 16.01.1998 Про введення Тимчасового порядку обліку та використання коштів від цільових портових зборів, що справляються в морських торговельних портах України
	Наказ N 19 від 21.01.1998. Про затвердження порядку присвоєння судну назви
	Наказ N 69 від 06.03.1998 Про затвердження Правил плавання і лоцманського проведення суден у північно-західній частині Чорного моря, Бузько-Дніпровсько-лиманському та Херсонському морському каналах
	Наказ N 93 від 27.03.1998. Про затвердження положення про збір за реєстрацію суден у державному судновому реєстрі України і судновій книзі України
	Наказ N 212 від 01.06.1998. Про внесення змін до наказу Міністерства транспорту України від 20 жовтня 1997 року N 369
	Наказ N 257 від 01.07.1998. Про затвердження Положення про відомчу пожежну охорону об'єктів морського і річкового транспорту України
	Наказ N 271 від 07.07.1989. Про впровадження глобальної морської системи зв'язку під час лиха та для забезпечення безпеки мореплавства
	Наказ N 348 від 31.08.1989. Про затвердження змін і доповнень до збірника тарифів на роботи та послуги, які надаються вантажовласникам морськими портами України, затвердженого наказом Міністерства транспорту України від 31.10.1995 N 392
	Наказ N 469 від 25.11.1998. Про затвердження порядку видачі одноразових тимчасових дозволів на захід до річкових портів України суднам під прапорами держав, з якими не укладено міжнародних договорів про судноплавство на внутрішніх водних шляхах
	Наказ N 480 від 03.12.1998. Про затвердження форми радіожурналу ГМЗЛБ та переліку документів з радіозв'язку й електрорадіонавігації
	Наказ N 497 від 14.12.1998. Про затвердження Положення про порядок підготовки та подання інформації про вантаж для його безпечного морського перевезення
	Наказ N 529 від 21.12.1998. Про порядок застосування знижок до ставки канального збору
	Наказ N 45 від 29.01.1999. Про внесення змін та доповнень до положення про порядок проведення комерційного продажу морських та річкових суден, що плавають під прапором України
	Наказ N 65 від 08.02.1999. Про закінчення перереєстрації суден, що мають право плавання під державним прапором України
	Наказ N 166 від 23.03.1999. Про затвердження порядку розподілу канальних зборів на Бузько-Дніпровсько-лиманському і Херсонському морських каналах та зборів за послуги постів регулювання руху суден "Очаків", "Руська коса" і "Касперівка"
	Наказ N 234 від 07.05.1999. Про визнання таким, що втратив чинність, наказу Міністерства транспорту України від 03.11.1994 N 579
	Наказ N 260 від 17.05.1999. Про затвердження Порядку укладання договорів страхування морських суден, що перебувають у державній власності і передаються судновласниками у фрахт, оренду, лізинг
	Наказ N 299 від 09.06.1999. Про затвердження порядку справляння плати за проходження суден шлюзами Дніпровського каскаду
	Наказ N 347 від 06.07.1999. Про запровадження тарифів на перевезення залізничним транспортом та переробку у портах окремих видів транзитних вантажів, що прямують через Керченський та Феодосійський морські торговельні порти
	Наказ N 359 від 12.07.1999. Про затвердження Інструкції про особливості відряджень членів екіпажів суден (інших транспортних засобів) та порядок виплати сум, що направляються на харчування членів екіпажів суден (інших транспортних засобів)
	Наказ N 459 від 20.09.1999. Про внесення доповнень до збірника тарифів на роботи та послуги, які надаються вантажовласникам морськими портами України, затвердженого наказом Міністерства транспорту України від 31.10.1995 N 392
	Наказ N 568 від 29.11.1999. Про затвердження Інструкції про заходи щодо недопущення незаконного проникнення сторонніх осіб у портах України та іноземних портах на судна закордонного плавання, що плавають під державним прапором України
	Наказ N 573 від 30.11.1999. Про внесення змін та доповнень до Положення про порядок проведення комерційного продажу морських та річкових суден, що плавають під прапором України